Genetic diversity of influenza A(H1N1)2009 virus circulating during the season 2010-2011 in Spain.

BACKGROUND: Genetic diversity of influenza A(H1N1)2009 viruses has been reported since the pandemic virus emerged in April 2009. Different genetic clades have been identified and defined based on amino acid substitutions found in the haemagglutinin (HA) protein sequences. In Spain, circulating influenza viruses are monitored each season by the regional laboratories enrolled in the Spanish Influenza Surveillance System (SISS). The analysis of the HA gene sequence helps to detect the genetic diversity and viral evolution. OBJECTIVES: To perform an analysis of the genetic diversity of influenza A(H1N1)2009 viruses circulating in Spain during the season 2010-2011 based on analysis of the HA sequence gene. STUDY DESIGN: Phylogenetic analysis based on the HA1 subunit of the haemagglutinin gene was carried out on 220 influenza A(H1N1)2009 viruses circulating during the season 2010-2011. RESULTS: Six different genetic groups were identified among circulating A(H1N1)2009 viruses, five of them were previously reported during season 2010-2011. A new group, characterized by E172K and K308E changes and a proline at position 83, was observed in 12.27% of the Spanish viruses. CONCLUSION: Co-circulation of six different genetic groups of influenza A(H1N1)2009 viruses was identified in Spain during the season 2010-2011. Nevertheless, at this stage, none of the groups identified to date have resulted in significant antigenic changes according to data collected by World Health Organization Collaborating Centres for influenza surveillance.

Resistencia a penicilina y otros antimicrobianos en 301 aislamientos clínicos de Streptococcus pneumoniae / Resistance to penicillin and other antimicrobials in 301 clinical isolates of Streptococcus pneumoniae

Fundamentos: Conocer en nuestra comunidad la sensibilidad a penicilina de aislamientos de Streptococcus pneumoniae, así como analizar la asociación de resistencia a penicilina y otros antimicrobianos y la actividad de cefotaxima y cefepima en cepas de S. pneumoniae con sensibilidad disminuida a penicilina. Métodos: Se determinó la sensibilidad de 301 aislamientos de S. pneumoniae, procedentes de muestras clínicas durante los años 1995-1996, a penicilina, cefotaxima, cefepima, eritromicina, cloramfenicol, tetraciclina, cotrimoxazol y ciprofloxacino. Resultados: El 38,2 por ciento de los aislamientos fueron sensibles a penicilina, mientras que un 61,8 por ciento de las cepas de S. pneumoniae aisladas fueron resistentes a penicilina, presentando el 20,6 por ciento resistencia de alto grado a la misma. La resistencia a eritromicina, cloramfenicol, tetraciclina, cotrimoxazol y ciprofloxacino fue del 30,9, 30,2, 40,9, 66,4 y 13,3 por ciento, respectivamente, incrementándose a valores del 54,8, 54,8, 61,3 y 93,5 por ciento en las 62 cepas con resistencia de alto nivel a penicilina. La resistencia a cefotaxima y cefepima fue del 13,9 y 14,9 por ciento, respectivamente. Los valores de la concentración inhibitoria mínima (CIM)50 y CIM90 para cefotaxima y cefepima en las cepas con sensibilidad disminuida a la penicilina fueron de 0,5 y 1 µg/ml, respectivamente. Conclusiones: Un alto porcentaje de cepas de S. pneumoniae presentaron algún grado de resistencia a penicilina, lo que concuerda con los resultados de otros estudios de ámbito nacional. Asimismo, se demostró que la resistencia a penicilina se asociaba significativamente (p < 0,001) con la resistencia a todos los antimicrobianos estudiados, excepto ciprofloxacino. Las CIM50 y CIM90 han sido equiparables para cefotaxima y cefepima, observándose CIM inferiores a las de la penicilina en las cepas de S. pneumoniae con resistencia de alto grado a la misma, con las consiguientes implicaciones terapéuticas (AU)